Een animatiefilm uit 1986 film gebaseerd op de geanimeerde TV-serie met dezelfde naam. Het werd uitgebracht in Noord-Amerika op 8 augustus 1986 en in het Verenigd Koninkrijk op 5 December 1986.

De film werd geregisseerd door Nelson Shin, die de originele Transformers televisieserie geproduceerd, en beschikt over de stemmen van Eric Idle, Judd Nelson, Leonard Nimoy, Casey Kasem, Robert Stack, Lionel Stander, John Moschitta, Jr., Peter Cullen en Frank Welker. Het ook de laatste rollen gemarkeerd voor zowel Orson Welles en Scatman Crothers.

Het verhaal vindt plaats in 2005, 20 jaar na de gebeurtenissen van de tweede seizoen van de TV-serie en dient om de brug in het derde seizoen. Set aan een soundtrack van toneelmuziek synth gebaseerde en hard-driving metal muziek, samengesteld door Vince DiCola, de film heeft een uitgesproken donkere ondertoon dan de TV-serie, met gedetailleerde visuals in typische anime film styling Toei Animation, en Decepticon schurken zijn meer dreigende, doden zonder aarzeling. De film beschikt over verscheidene grote veldslagen waarin een handvol belangrijke personages voldoen aan hun einde. De film slogan was: "Beyond goed. Dan kwaad. Voorbij uw wildste verbeelding".

Unicron, een zwervende kunstmatige planeet, verslindt robot planeet Lithone, en slechts twee inwoners vluchten. Het kwaad Decepticons besturingselement de Transformers thuiswereld, Cybertron. De heldhaftige die Autobots zijn met behulp van twee van de Cybertron manen als enscenering gebieden, voorbereiden om te staking tegen de Decepticons. Behoefte aan energon kubussen, een Autobot shuttle is klaargemaakt voor de lancering tot Autobot stad op aarde. Een transmissie is onderschept door de Decepticons, die de shuttle, hinderlaag doden Brawn, jacht, Ratchet en Ironhide, plan te gebruiken van het schip om te infiltreren Autobot stad.

Op aarde, Daniel Witwicky en Hot Rod vissen in een meer in de buurt van Autobot stad, bespreken Daniel van eenzaamheid, als zijn vader die Spike op een van de grondslagen van de maan is. Ze halen de shuttle handtekening, en race tot Lookout Mountain om het te zien land. Zij ter plaatse de Decepticons en lanceren van een preëmptieve aanval. Na een kort gevecht, de Decepticons aanval Autobot stad. De Autobots, met inbegrip van Ultra Magnus, Blurr, Springer, Perceptor en Arcee, transformatie Autobot stad in een vesting. Zoals een belegering ensues, Ultra Magnus Blaster bestellingen naar radio voor bijstand van de leider van de Autobots, Optimus Prime. De volgende ochtend, Optimus en de Dinobots aankomen en met succes af te weren de Decepticons aanval.

Optimus confronteert de Decepticon leider, Megatron. Hoewel Megatron is versloeg, Optimus is dodelijk gewond geraakt als gevolg van Hot Rods onbedoelde inmenging. Starscream neemt opdracht van de Decepticons en retraites met hun gevallen leider en andere gewond aan boord van Astrotrain.

Perceptor informeert de andere Autobots zijn Optimus van wonden fatale. Voor zijn dood, Optimus verzoekt Ultra Magnus op zich te nemen commando van de Autobots en probeert te geven hem de Autobot Matrix van leiderschap, bewerend dat de Matrix één dag de Autobots donkerste uur licht zal. The Matrix valt uit Optimus de hand, maar wordt gevangen door Hot Rod, die aan Ultra Magnus doorgegeven. Optimus monitor dan flatlines en hij draait grijs en sterft.

Astrotrain tekort aan brandstof wordt gevraagd de Decepticons om uit te werpen de Insecticons, Thundercracker, Skywarp en Megatron. De resterende Decepticons twisten wie hen zou moeten leiden. The Decepticon castoffs tegenkomen Unicron, die biedt te geven Megatron en de anderen nieuwe organen op voorwaarde dat ze de Autobot Matrix vernietigen, die Unicron zegt is het enige dat hem kan verslaan. Megatron met tegenzin stemt en Unicron zet hem in een nieuw formulier: de Decepticon warrior "Galvatron". Zijn minderen zijn geformatteerd in Cyclonus, plaag en de Sweeps. Unicron biedt hen met een ambacht waarin zij naar Cybertron reizen, waar Galvatron uitwist Starscream en opnieuw neemt bevel van de Decepticons.

Op aarde, de Autobots zijn gewaarschuwd als Unicron Cybertron van manen, samen met de Autobots Jazz, Bumblebee, Cliffjumper verbruikt, en Spike. Galvatron leidt de Decepticons in een andere aanval op de Autobot stad. De Autobots aan boord van een paar van shuttles en vluchten naar Cybertron. Hot Rod, Kup en de Dinobots zijn neergeschoten boven de planeet Quintessa, terwijl Ultra Magnus en bedrijf onttrekken aan hun achtervolgers en vastgelegd op de planeet ongewenste voor reparaties.

Geslagen door Quintessa guardsmen, Hot Rod en Kup getuige de veroordeling en uitvoering van Arbulus, een inwoner van Lithone. Tijdens zijn gevangenschap ontmoeten ze elkaar Kranix, nu Lithone de laatste overlevende, die hen over Unicron vertelt voordat hij wordt gevoed aan de Sharkticons. Hot Rod en Kup worden onderworpen aan een mock trial door Quintesson beulen, die zin hen tot uitvoering. Vechten de Sharkticons, zijn ze gered door de komst van de Dinobots. Grimlock overreedt de Sharkticons om binnen te rebelleren tegen de Quintessons terwijl de Autobots ontsnappen. Met hulp van de Dinobots nieuwe bondgenoot, Wheelie, de groep zoekt een schip en vertrekt om toetreding tot de andere Autobots.

Galvatron jaagt beneden de Autobots op Junk. Ultra Magnus er niet in slaagt om te ontwaken de Matrix bevoegdheden, en is verscheurd door de Sweeps. Galvatron, niet langer bereid om te dienen Unicron, steelt de Matrix, van plan te maken Unicron zijn slaaf. De resterende Autobots zijn lastiggevallen door vijandige inboorlingen van de Junkion, onder leiding van wrak-Gar, totdat Hot Rods partij aankomt en raakt bevriend met hen. De Junkions Ultra Magnus herstellen en zorgen voor een schip om te helpen de Autobots bestrijding van Unicron.

Galvatron probeert te onderwerpen Unicron met behulp van de Matrix, maar is niet in staat om haar macht los te laten. Unicron transformaties in een planeet en middelgrote robot en aanvallen Cybertron en doodt Dirge, stuwkracht, Ramjet en Shockwave. Galvatron brand op Unicron opent, maar Unicron slikt hem. Decepticons poging ter bestrijding van Unicron de aanval, tevergeefs. Wanneer de Autobots Hot Rod aankomen crashes hun schip door één van Unicron de ogen en zij verkeren gescheiden binnen zijn lichaam. Wrak-Gar en de Junkions terug tegen Unicron te vechten, maar Unicron verplettert hun schip.

Binnen Unicron, Hot Rod confronteert Galvatron terwijl Daniel en de andere Autobots Spike en de overlevenden van Unicron de aanval op de Cybertron manen redden. De Autobots en Decepticons werk samen ter bestrijding van Unicron. Galvatron probeert te helpen Hot Rod, wetende dat Unicron een grotere bedreiging, alleen voor Unicron is te dwingen Galvatron om aan te vallen. Hot Rod herstelt de Matrix en ontketent zijn macht, hem om te zetten in Rodimus Prime. Rodimus gooit Galvatron in ruimte en ontketent de ware kracht van de Matrix, vernietiging van Unicron. Rodimus leidt de Autobots uit Unicron van lichaam voordat het ontploft. De Autobots reclaim Cybertron. Van Unicron hoofd banen Cybertron als een nieuwe satelliet.